sábado, 18 de agosto de 2018

El Sinaptoma: Un nuevo mapa cerebral obtenido en ratón, tan específico como para permitir rastrear la formación de los pensamientos





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Aún no tenemos un mapa astronómico de los cielos con el detalle de todas sus estrellas, sin embargo, gracias a un estudio trascendental publicado  en Neuron, ahora ya tenemos  uno de un  cerebro muy complejo.

Si cada neurona fuera una galaxia, entonces las sinapsis (estructuras pequeñas diseminadas a lo largo de las extensiones serpentinas de las neuronas) serían  sus estrellas. En un tour-de-force técnico, un equipo de la Universidad de Edimburgo en el Reino Unido construyó el primer mapa detallado de cada sinapsis existente en el cerebro del  ratón.

Usando ratones genéticamente modificados, el equipo literalmente hizo que cada sinapsis del cerebro se iluminara con luz fluorescente al igual que una  noche estrellada. Y, al igual que difieren las estrellas, el equipo descubrió que las sinapsis son muy variadas, pero siguiendo unos patrones sorprendentes  que podrían respaldar la formación tanto de  la memoria como del pensamiento.

"Hay más sinapsis en el cerebro humano que estrellas en la galaxia. El cerebro es el objeto más complejo que conocemos y entender sus conexiones a este nivel es un gran paso adelante para desentrañar sus misterios ", expuso  el Dr. Seth Grant autor principal de la publicación.

El detalle de los mapas obtenidos reveló una ley fundamental de la actividad cerebral. Con la ayuda de la Inteligencia Artificial, el equipo clasificó aproximadamente mil millones de sinapsis, detectadas en el cerebro, en 37 subtipos. Aquí está la clave: cuando un  conjunto de neuronas recibe información mediante activación eléctrica, tal como tratar de decidir entre diferentes soluciones para un problema, los subtipos únicos de sinapsis repartidos entre diferentes neuronas se activan a la vez.

En otras palabras: las sinapsis se diferencian en tipos. Y cada tipo podría generar un pensamiento, una decisión o un recuerdo.

 


El Conectoma


El interés del equipo en la construcción del "sinaptoma" -el primer catálogo completo de sinapsis en el cerebro del ratón- provino de un proyecto mucho más grande: el Conectoma.

En pocas palabras, el Conectoma son todas las conexiones neuronales dentro de un cerebro. Según lo expresa el Dr. Sebastian Seung en una charla de TED, el conectoma es la base biológica de lo que somos: los recuerdos, la personalidad, y cómo se razona y se piensa. Si se captura el conectoma de un ser vivo,  algún día los científicos podrán reconstruirlo, algo que se conoce como emulación cerebral completa.

Sin embargo, el conectoma solo describe cómo las neuronas se comunican funcionalmente entre sí. ¿Pero en qué parte del cerebro está físicamente codificado un pensamiento o un recuerdo?

Y aquí entran las sinapsis. Los neurocientíficos saben desde hace tiempo que las sinapsis transmiten información entre las neuronas mediante neurotransmisores y electricidad. También ha habido indicios de que las sinapsis son muy diversas en términos de qué proteínas contienen, pero tradicionalmente esta diversidad habia sido ignorada. Hasta hace poco, la mayoría de los científicos creían que el tratamiento de la información  ocurría en el cuerpo neuronal, la parte central de una neurona desde la cual se extienden las ramas.

Hasta ahora, no se tenía una forma de ver la morfología y la función de las sinapsis en todo el cerebro, según los investigadores. Mas bien, la investigación se había centrado en el mapeo en pequeñas áreas de estos puntos de conexión cruciales.


 MAPA DE LAS SINAPSIS O SINAPTOMA


Para construir el sinaptoma de ratón, los investigadores desarrollaron una estrategia que denominaron SYNMAP. Comenzaron con ratones genéticamente modificados, cuyas sinapsis brillan en diferentes colores. Cada sinapsis contiene en su estructura  proteínas que las diferencian. Entre ellas, las proteínas denominadas PSD-95 y SAP102 son dos de los miembros más destacados. Los investigadores  agregaron proteínas con luminiscencia a estos dos tipos de proteínas para que esencialmente actuaran como antorchas para iluminar cada sinapsis en el cerebro.


Synaptome Mapping Pipeline
Estrategia del mapeo del sinaptoma:  El equipo primero modificó el genoma del ratón generando sinapsis
 que aparecían brillantes 
 bajo luz fluorescente.



Luego, cortaron laboriosamente el cerebro en rodajas, y usaron un microscopio para capturar imágenes de sinapsis en diferentes regiones cerebrales y reconstruyeron la anatomía cerebral a partir de las imágenes obtenidas.

Una imagen de un conjunto de sinapsis aparece como un mapa estelar densamente empaquetado a ojos de una persona  inexperta. Categorizar cada sinapsis va más allá de la capacidad (y del tiempo disponible) de cualquier investigador humano, por lo que el equipo aprovechó las nuevas técnicas de Inteligencia Artificial  y desarrolló un algoritmo que podía analizar estos datos (más de 10 terabytes) sin supervisión humana.


 Un Conectoma  Físico


Desde el principio, el equipo quedó impresionado por los "patrones exquisitos" que formaban las sinapsis luminiscentes. Una proteína, etiquetada como PSD-95, se expresó con intensidad en las regiones más exteriores del cerebro donde ocurren las  funciones cognitivas superiores. Aunque hay superposición, la otra proteína luminiscente  utilizada prefirió regiones mas interiores del cerebro.


Whole-Brain-Scale Mapping
Mapeo de escala cerebral completa:
Las imágenes de microscopio que muestran las dos proteínas de sinapsis luminiscentes,
 PSD-95 y SAP102, en distintas secciones del cerebro.

Cuando examinaron con detalle las imágenes obtenidas, los investigadores descubrieron que las dos proteínas luminiscentes representaban diferentes conjuntos de sinapsis. Cada región del cerebro expresaba una "firma de sinaptoma" característica. Al igual que las huellas dactilares que difieren en forma y tamaño, las varias regiones cerebrales también parecían contener sinapsis que difieren en su composición, tamaño y número de proteínas.

Utilizando un algoritmo de Inteligencia artificial desarrollado internamente, el equipo clasificó las sinapsis en 37 subtipos. Sorprendentemente, las regiones del cerebro relacionadas con el razonamiento superior y las capacidades de pensamiento también contenían la población de sinapsis más diversa, mientras que las "regiones de cerebro de reptiles", como el tronco cerebral, eran más uniformes en el subtipo de sinapsis.


Synaptome dominant subtype maps
Mapas de subtipos dominantes de Sinaptoma: 
Un gráfico de una sección transversal del cerebro
 que muestra algunos de los subtipos de sinapsis más comunes en cada área.
 Cada color representa un subtipo de sinapsis diferente. 
El recuadro enmarca el hipocampo.

 


¿Por qué?


Para dilucidar si la diversidad de las sinapsis ayuda con el procesamiento de la información, el equipo utilizó simulaciones por ordenador para ver cómo las sinapsis responderían a los patrones eléctricos comunes dentro del hipocampo, la región en forma de caballito de mar crucial para el aprendizaje y la memoria. El hipocampo fue una de las regiones que mostró una diversidad notable en los subtipos de sinapsis, con cada uno de los subtipos expresándose en patrones llamativos a través de esta estructura cerebral.

Sorprendentemente, cada tipo de procesamiento de información eléctrica se traduce en un mapa de sinaptoma único: si cambia el impulso eléctrico, cambia el sinaptoma. Ello sugiere que el cerebro puede procesar información eléctrica múltiple usando la misma región del cerebro, porque se activan diferentes sinaptomas.

El equipo encontró resultados similares al analizar los  patrones eléctricos registrados en ratones que intentaban elegir entre tres opciones para obtener una recompensa. Se iluminaron diferentes sinaptomas si la elección era correcta versus la elección incorrecta. Al igual que un mapa en pensamientos internos, los sinaptomas dibujaron una imagen vívida de lo que el ratón estaba pensando cuando hizo su elección.



Synaptome map function behavior and physiology

Comportamiento y fisiología de la función del mapa de sinaptoma:
 Cada comportamiento activa un sinaptoma particular.
 Cada sinaptoma es como una huella digital única de un proceso de pensamiento.


Reprogramación del Sinaptoma


Al igual que con un programa de ordenador, un sinaptoma parece subyacer a un resultado: una decisión o pensamiento. Entonces, ¿qué pasa si el código está corrompido?

Las enfermedades psiquiátricas a menudo tienen causas genéticas que afectan a las proteínas en la sinapsis. Usando ratones que mostraban síntomas similares a la esquizofrenia o el autismo, el equipo mapeó su sinaptoma y descubrió cambios dramáticos en la estructura y conexión de los diversos subtipos de sinapsis del cerebro.

Por ejemplo, en respuesta a ciertos patrones eléctricos cerebrales normales, en los ratones mutantes, con enfermedades psiquiátricas provocadas, algunos mapas de sinaptomas solo surgieron débilmente, mientras que otros se volvieron anormalmente fuertes.



Synaptome reprogramming
Reprogramación de Sinaptoma:
Las mutaciones pueden cambiar el sinaptoma
 y conducir potencialmente a trastornos psiquiátricos



Parece que ciertas enfermedades psiquiátricas "reprograman" el sinaptoma, concluyeron los investigadores. Los mapas de sinaptoma más fuertes o distintos podrían, de hecho, ser la razón por la cual los pacientes con esquizofrenia experimentan delirios y alucinaciones.


Entonces, ¿somos nuestro  Sinaptoma?


Quizás. Nuestra esencia, esto es, nuestros recuerdos, o nuestros patrones de pensamiento, parece estar grabada en cómo las diversas sinapsis se activan en respuesta a un estímulo eléctrico. Al igual que una huella dactilar para recuerdos y decisiones, los sinaptomas podrían "leerse" a posteriori, para descifrar ese pensamiento.

Pero como reconocen los investigadores, el estudio es solo el comienzo. Junto con la publicación científica, el equipo lanzó una herramienta llamada Synaptome Explorer para ayudar a los neurocientíficos a analizar las  intricadas conexiones entre las sinapsis y el comportamiento.

"Este nueva forma de analizar el cerebro abre nuevas vías a  investigaciones  que deberían transformar nuestra comprensión del comportamiento y la enfermedad cerebral" según Grant. 




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