jueves, 2 de julio de 2020

Mutaciones genéticas tras la ansiedad y el abuso de alcohol




Debido a nuestra superioridad intelectual sobre otros mamíferos, los genetistas solían pensar que necesitábamos al menos 100,000 genes para apreciar a Verdi  o paladear un buen vino. Pero resultó que todos los mamíferos, desde ratones hasta humanos, comparten el mismo conjunto de aproximadamente 20,000 genes. Tras digerir este descubrimiento, al menos se encontró una oportunidad: menos genes significaban una búsqueda más fácil de mutaciones genéticas causantes de enfermedades, particularmente porque también resultó que los genes que codificaban proteínas solo representaban el 2% del genoma.



Un interruptor para el ADN




¡No tan facil!


Los genetistas intentaron explotar las revelaciones sobre el genoma con estudios que analizaron miles de pequeños cambios genéticos en cientos de miles de pacientes con diferentes enfermedades para ver cómo se comparaban con las personas sanas. Esto les permitió correlacionar los cambios genéticos en el ADN enfermo de una manera antes  inimaginable. Como resultado, la "arquitectura genética" de una gran cantidad de afecciones, desde el cáncer hasta la esquizofrenia y la adicción, se entendió mucho mejor.

Sin embargo, después de que se publicaron los primeros miles de estudios, los genetistas se horrorizaron al descubrir que el 98% de los cambios asociados con la enfermedad que habían identificado en el genoma, no ocurren realmente en los genes que codifican proteinas. En cambio, la gran mayoría de los cambios relacionados con las enfermedades de origen genético  se producen en el 98% del genoma que no está formado por genes, conocido como el "genoma basura", ya que al principio no se tenía  una noción más clara de lo que era o cómo estudiarlo.

En este punto, apareció un caballero blanco en forma de 440 científicos de todo el mundo conocido como el consorcio ENCODE. Con sede en Stanford, ENCODE se esforzó en la preparación de la "Enciclopedia del genoma humano", acumulando enormes cantidades de datos para descubrir qué estaba sucediendo en el genoma basura.

ENCODE  proclamó que al menos el 10% del genoma humano estaba formado por interruptores genéticos llamados potenciadores que activan y desactivan genes. Pero si esto sonaba como la clave para acercarse a un tratamiento efectivo de muchas  enfermedades genéticas, pronto se vería la dificultad asociada.

Los científicos sugirieron que estas secuencias complejas de ADN evolucionan continuamente a alta velocidad, lo que implica que no son tan importantes como los genes. También pueden ser únicos para especies individuales en lugar de ser comunes para muchas especies, como los genes codificantes de proteinas. Junto con los hallazgos de que los potenciadores parecían ser bastante transitorios y efímeros en el genoma, comenzó a parecer que nuestra capacidad para comprender rápidamente el genoma humano podría haberse sobrevalorado.

 


Un enfoque alternativo


Algunos genetistas, ahora cuestionan los anteriores paradigmas. Esto se relaciona con la forma en que los científicos han identificado potenciadores hasta ahora: donde podemos reconocer genes muy claramente usando un sistema de códigos de tres letras, ENCODE identificó potenciadores usando pruebas de marcadores bioquímicos.

Sin embargo, podría decirse que no hay pruebas suficientes para confiar en que los "marcadores potenciadores" en estas pruebas identifiquen con precisión todos los potenciadores del genoma. Más fundamentalmente, el uso de los marcadores presupone que los potenciadores deberían comportarse de manera uniforme. Si, en cambio, solo están activos en células específicas en momentos específicos, las pruebas de marcadores bioquímicos no siempre serán precisas, ya que no pueden reflejar la actividad de todos los potenciadores en las regiones muy específicas en las que están activas. Si es así, los potenciadores pueden conservarse en los genomas de muchas más especies de lo que sugerían los estudios de marcadores bioquímicos anteriores.

Para probar esta idea, las Universidades de Aberdeen y Edimburgo han estado colaborando para identificar las causas genéticas de la ansiedad y el abuso del alcohol, que mata al 7.7% de los hombres y al 2.6% de las mujeres en todo el mundo. Para hacer esto, el estudio se realizó en  ratones, ya que ellos también pueden ser susceptibles al alcoholismo cuando están expuestos al alcohol.






Hay un gen llamado GAL que produce un pequeño neuropéptido llamado galanina, que afecta la ingesta de alcohol. Sin embargo, se sabe que cuando se compara a las personas que beben mucho con las que no, no se ven diferencias en el gen GAL. Al estudiar este gen en ratones, se identificó lo que parecía ser un potenciador que activaba este gen en regiones específicas de su cerebro.


Galanina


Al comparar las secuencias del genoma de 100 especies animales, incluidos humanos, ratones y aves, se encontró el mismo potenciador sospechoso en el genoma, en casi la misma posición, a cierta distancia del gen. Teniendo en cuenta que las ramas evolutivas de las aves y los hombres  se separaron hace unos 310 millones de años, el hecho de que esta entidad haya sobrevivido hace que sea extremadamente probable que sea fundamental para el control de la ingesta del alcohol.

Para probar esto, se utilizó una nueva tecnología de edición de genes para eliminar el potenciador en el cerebro de los  ratones modificados genéticamente. Efectivamente, se descubrió que los ratones editados genéticamente bebieron mucho menos que los ratones normales después de una semana de exposición al alcohol. También se volvieron menos ansiosos, aunque solo los machos. Con la ayuda de estudios genéticos humanos en la Universidad de Edimburgo, esto permitió concluir que en humanos el mismo potenciador juega un papel importante en el control del estado de ánimo y el consumo de alcohol de las personas.

Esta es la primera vez que se ha demostrado que el mismo potenciador controla el consumo de alcohol y el estado de ánimo en una gran cantidad de especies. Sugiere que los potenciadores con funciones importantes se pueden detectar en el genoma humano al observar en qué medida existen en diferentes especies. Lejos de ser las entidades transitorias y efímeras sugeridas por los estudios de marcadores bioquímicos, esta investigación  demuestra que los potenciadores son críticos para impulsar la expresión de genes específicos en células específicas donde desempeñan funciones importantes en el mantenimiento de la salud.


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